Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm29394H3BIW7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm29394H3BIW7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm29394H3BIW7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.7 ms