Protein–RNA interactions for Protein: G5E8S3

E230025N22Rik, Riken cDNA E230025N22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E230025N22RikG5E8S3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E230025N22RikG5E8S3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E230025N22RikG5E8S3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms