Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp2b1G5E829 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2b1G5E829 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b1G5E829 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b1G5E829 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b1G5E829 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b1G5E829 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b1G5E829 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b1G5E829 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b1G5E829 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b1G5E829 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b1G5E829 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b1G5E829 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b1G5E829 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b1G5E829 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b1G5E829 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b1G5E829 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b1G5E829 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b1G5E829 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b1G5E829 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b1G5E829 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b1G5E829 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b1G5E829 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b1G5E829 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2b1G5E829 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2b1G5E829 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2b1G5E829 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms