Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nkx1-1G3UXB3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nkx1-1G3UXB3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Nkx1-1G3UXB3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nkx1-1G3UXB3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nkx1-1G3UXB3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nkx1-1G3UXB3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nkx1-1G3UXB3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nkx1-1G3UXB3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nkx1-1G3UXB3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nkx1-1G3UXB3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nkx1-1G3UXB3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx1-1G3UXB3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx1-1G3UXB3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx1-1G3UXB3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nkx1-1G3UXB3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx1-1G3UXB3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx1-1G3UXB3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx1-1G3UXB3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx1-1G3UXB3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx1-1G3UXB3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nkx1-1G3UXB3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nkx1-1G3UXB3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nkx1-1G3UXB3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nkx1-1G3UXB3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nkx1-1G3UXB3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nkx1-1G3UXB3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx1-1G3UXB3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx1-1G3UXB3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx1-1G3UXB3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx1-1G3UXB3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nkx1-1G3UXB3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nkx1-1G3UXB3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nkx1-1G3UXB3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nkx1-1G3UXB3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nkx1-1G3UXB3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nkx1-1G3UXB3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nkx1-1G3UXB3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms