Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NpcdF8VQB8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NpcdF8VQB8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NpcdF8VQB8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NpcdF8VQB8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NpcdF8VQB8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NpcdF8VQB8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NpcdF8VQB8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NpcdF8VQB8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NpcdF8VQB8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NpcdF8VQB8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NpcdF8VQB8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NpcdF8VQB8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NpcdF8VQB8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NpcdF8VQB8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NpcdF8VQB8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NpcdF8VQB8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NpcdF8VQB8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NpcdF8VQB8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NpcdF8VQB8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms