Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
D430041D05RikF6ZGR6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
D430041D05RikF6ZGR6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
D430041D05RikF6ZGR6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
D430041D05RikF6ZGR6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
D430041D05RikF6ZGR6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
D430041D05RikF6ZGR6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
D430041D05RikF6ZGR6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
D430041D05RikF6ZGR6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
D430041D05RikF6ZGR6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
D430041D05RikF6ZGR6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
D430041D05RikF6ZGR6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
D430041D05RikF6ZGR6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
D430041D05RikF6ZGR6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
D430041D05RikF6ZGR6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
D430041D05RikF6ZGR6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
D430041D05RikF6ZGR6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
D430041D05RikF6ZGR6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
D430041D05RikF6ZGR6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
D430041D05RikF6ZGR6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
D430041D05RikF6ZGR6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
D430041D05RikF6ZGR6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
D430041D05RikF6ZGR6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
D430041D05RikF6ZGR6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
D430041D05RikF6ZGR6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
D430041D05RikF6ZGR6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
D430041D05RikF6ZGR6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
D430041D05RikF6ZGR6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
D430041D05RikF6ZGR6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
D430041D05RikF6ZGR6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
D430041D05RikF6ZGR6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
D430041D05RikF6ZGR6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
D430041D05RikF6ZGR6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
D430041D05RikF6ZGR6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.82■■■□□ 2.37
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
D430041D05RikF6ZGR6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
D430041D05RikF6ZGR6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
D430041D05RikF6ZGR6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
D430041D05RikF6ZGR6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
D430041D05RikF6ZGR6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
D430041D05RikF6ZGR6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
D430041D05RikF6ZGR6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
D430041D05RikF6ZGR6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
D430041D05RikF6ZGR6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
D430041D05RikF6ZGR6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms