Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
3110082J24RikF6Z6Z2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
3110082J24RikF6Z6Z2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
3110082J24RikF6Z6Z2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
3110082J24RikF6Z6Z2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
3110082J24RikF6Z6Z2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
3110082J24RikF6Z6Z2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
3110082J24RikF6Z6Z2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
3110082J24RikF6Z6Z2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
3110082J24RikF6Z6Z2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
3110082J24RikF6Z6Z2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
3110082J24RikF6Z6Z2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
3110082J24RikF6Z6Z2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
3110082J24RikF6Z6Z2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms