Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm8005F6YKY3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm8005F6YKY3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8005F6YKY3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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