Protein–RNA interactions for Protein: F6V035

Ccdc149, Coiled-coil domain-containing 149, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc149F6V035 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc149F6V035 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc149F6V035 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc149F6V035 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms