Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sptbn5F6UCX4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sptbn5F6UCX4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sptbn5F6UCX4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sptbn5F6UCX4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sptbn5F6UCX4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sptbn5F6UCX4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sptbn5F6UCX4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms