Protein–RNA interactions for Protein: F6R5P4

Ccl17, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl17F6R5P4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl17F6R5P4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl17F6R5P4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms