Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmod3E9QA62 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod3E9QA62 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod3E9QA62 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms