Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc7bE9Q9Y3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms