Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp31E9Q6Y8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp31E9Q6Y8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp31E9Q6Y8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms