Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
UtrnE9Q6R7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UtrnE9Q6R7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UtrnE9Q6R7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UtrnE9Q6R7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UtrnE9Q6R7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms