Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc85cE9Q6B2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc85cE9Q6B2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc85cE9Q6B2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc85cE9Q6B2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc85cE9Q6B2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc85cE9Q6B2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc85cE9Q6B2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc85cE9Q6B2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc85cE9Q6B2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc85cE9Q6B2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc85cE9Q6B2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc85cE9Q6B2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc85cE9Q6B2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc85cE9Q6B2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc85cE9Q6B2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc85cE9Q6B2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc85cE9Q6B2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc85cE9Q6B2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc85cE9Q6B2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc85cE9Q6B2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms