Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pate1E9Q658 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pate1E9Q658 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pate1E9Q658 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pate1E9Q658 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pate1E9Q658 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pate1E9Q658 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pate1E9Q658 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pate1E9Q658 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pate1E9Q658 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pate1E9Q658 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pate1E9Q658 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pate1E9Q658 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pate1E9Q658 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pate1E9Q658 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pate1E9Q658 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pate1E9Q658 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pate1E9Q658 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pate1E9Q658 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pate1E9Q658 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms