Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtproE9Q612 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtproE9Q612 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PtproE9Q612 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms