Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trip11E9Q512 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trip11E9Q512 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trip11E9Q512 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trip11E9Q512 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms