Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
8030474K03RikE9Q4Y8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
8030474K03RikE9Q4Y8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
8030474K03RikE9Q4Y8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
8030474K03RikE9Q4Y8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
8030474K03RikE9Q4Y8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
8030474K03RikE9Q4Y8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
8030474K03RikE9Q4Y8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
8030474K03RikE9Q4Y8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
8030474K03RikE9Q4Y8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
8030474K03RikE9Q4Y8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
8030474K03RikE9Q4Y8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
8030474K03RikE9Q4Y8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
8030474K03RikE9Q4Y8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
8030474K03RikE9Q4Y8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
8030474K03RikE9Q4Y8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
8030474K03RikE9Q4Y8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
8030474K03RikE9Q4Y8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
8030474K03RikE9Q4Y8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
8030474K03RikE9Q4Y8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
8030474K03RikE9Q4Y8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
8030474K03RikE9Q4Y8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms