Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms