Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ApobE9Q414 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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