Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3Z1

B230217C12Rik, RIKEN cDNA B230217C12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230217C12RikE9Q3Z1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B230217C12RikE9Q3Z1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms