Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3T6

Prdm14, PR domain zinc finger protein 14, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm14E9Q3T6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Prdm14E9Q3T6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Prdm14E9Q3T6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Prdm14E9Q3T6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Prdm14E9Q3T6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Prdm14E9Q3T6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prdm14E9Q3T6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prdm14E9Q3T6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prdm14E9Q3T6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prdm14E9Q3T6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prdm14E9Q3T6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prdm14E9Q3T6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prdm14E9Q3T6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Prdm14E9Q3T6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Prdm14E9Q3T6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Prdm14E9Q3T6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Prdm14E9Q3T6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prdm14E9Q3T6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prdm14E9Q3T6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prdm14E9Q3T6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prdm14E9Q3T6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prdm14E9Q3T6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prdm14E9Q3T6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prdm14E9Q3T6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prdm14E9Q3T6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prdm14E9Q3T6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prdm14E9Q3T6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prdm14E9Q3T6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prdm14E9Q3T6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Prdm14E9Q3T6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms