Protein–RNA interactions for Protein: E9Q355

Catsperg1, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg1E9Q355 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Catsperg1E9Q355 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Catsperg1E9Q355 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Catsperg1E9Q355 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Catsperg1E9Q355 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Catsperg1E9Q355 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Catsperg1E9Q355 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Catsperg1E9Q355 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Catsperg1E9Q355 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Catsperg1E9Q355 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Catsperg1E9Q355 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Catsperg1E9Q355 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Catsperg1E9Q355 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Catsperg1E9Q355 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Catsperg1E9Q355 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Catsperg1E9Q355 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Catsperg1E9Q355 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Catsperg1E9Q355 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms