Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Abcc4E9Q236 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc4E9Q236 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Abcc4E9Q236 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc4E9Q236 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms