Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
NebE9Q1W3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NebE9Q1W3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
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