Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc171E9Q1U1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc171E9Q1U1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms