Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zfp558E9Q1J0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Zfp558E9Q1J0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Zfp558E9Q1J0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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