Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm3893E9Q1I1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gm3893E9Q1I1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm3893E9Q1I1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm3893E9Q1I1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm3893E9Q1I1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm3893E9Q1I1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm3893E9Q1I1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm3893E9Q1I1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm3893E9Q1I1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm3893E9Q1I1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm3893E9Q1I1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm3893E9Q1I1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm3893E9Q1I1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm3893E9Q1I1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm3893E9Q1I1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm3893E9Q1I1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3893E9Q1I1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3893E9Q1I1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3893E9Q1I1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm3893E9Q1I1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm3893E9Q1I1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
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