Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E430018J23RikE9PZQ8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
E430018J23RikE9PZQ8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E430018J23RikE9PZQ8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms