Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ddx60E9PZQ1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ddx60E9PZQ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ddx60E9PZQ1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ddx60E9PZQ1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ddx60E9PZQ1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ddx60E9PZQ1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ddx60E9PZQ1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ddx60E9PZQ1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ddx60E9PZQ1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ddx60E9PZQ1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ddx60E9PZQ1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ddx60E9PZQ1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ddx60E9PZQ1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ddx60E9PZQ1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ddx60E9PZQ1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ddx60E9PZQ1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ddx60E9PZQ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ddx60E9PZQ1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ddx60E9PZQ1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ddx60E9PZQ1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddx60E9PZQ1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddx60E9PZQ1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddx60E9PZQ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddx60E9PZQ1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ddx60E9PZQ1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ddx60E9PZQ1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ddx60E9PZQ1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ddx60E9PZQ1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddx60E9PZQ1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.5 ms