Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gcom1E9PZ54 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcom1E9PZ54 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcom1E9PZ54 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms