Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Srp54bE9PXC0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Srp54bE9PXC0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms