Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc144bE9PVZ3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc144bE9PVZ3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms