Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Cngb1E1AZ71 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Cngb1E1AZ71 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cngb1E1AZ71 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cngb1E1AZ71 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cngb1E1AZ71 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Cngb1E1AZ71 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Cngb1E1AZ71 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Cngb1E1AZ71 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Cngb1E1AZ71 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Cngb1E1AZ71 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Cngb1E1AZ71 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Cngb1E1AZ71 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Cngb1E1AZ71 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Cngb1E1AZ71 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Cngb1E1AZ71 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Cngb1E1AZ71 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Cngb1E1AZ71 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Cngb1E1AZ71 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Cngb1E1AZ71 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Cngb1E1AZ71 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Cngb1E1AZ71 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Cngb1E1AZ71 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Cngb1E1AZ71 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Cngb1E1AZ71 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Cngb1E1AZ71 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Cngb1E1AZ71 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Cngb1E1AZ71 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Cngb1E1AZ71 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Cngb1E1AZ71 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Cngb1E1AZ71 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Cngb1E1AZ71 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Cngb1E1AZ71 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Cngb1E1AZ71 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Cngb1E1AZ71 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Cngb1E1AZ71 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
Cngb1E1AZ71 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
Cngb1E1AZ71 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Cngb1E1AZ71 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Cngb1E1AZ71 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Cngb1E1AZ71 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Cngb1E1AZ71 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cngb1E1AZ71 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cngb1E1AZ71 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cngb1E1AZ71 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cngb1E1AZ71 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Cngb1E1AZ71 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Cngb1E1AZ71 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cngb1E1AZ71 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cngb1E1AZ71 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Cngb1E1AZ71 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Cngb1E1AZ71 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Cngb1E1AZ71 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Cngb1E1AZ71 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Cngb1E1AZ71 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Cngb1E1AZ71 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cngb1E1AZ71 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Cngb1E1AZ71 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cngb1E1AZ71 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cngb1E1AZ71 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cngb1E1AZ71 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cngb1E1AZ71 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Cngb1E1AZ71 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Cngb1E1AZ71 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Cngb1E1AZ71 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cngb1E1AZ71 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cngb1E1AZ71 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms