Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930444G20RikD3Z741 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
4930444G20RikD3Z741 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930444G20RikD3Z741 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930444G20RikD3Z741 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930444G20RikD3Z741 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930444G20RikD3Z741 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930444G20RikD3Z741 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930444G20RikD3Z741 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930444G20RikD3Z741 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930444G20RikD3Z741 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930444G20RikD3Z741 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930444G20RikD3Z741 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930444G20RikD3Z741 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930444G20RikD3Z741 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930444G20RikD3Z741 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930444G20RikD3Z741 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930444G20RikD3Z741 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
4930444G20RikD3Z741 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930444G20RikD3Z741 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms