Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5F7

Gm20521, Predicted gene 20521, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20521D3Z5F7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Gm20521D3Z5F7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Gm20521D3Z5F7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Gm20521D3Z5F7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Gm20521D3Z5F7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Gm20521D3Z5F7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Gm20521D3Z5F7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Gm20521D3Z5F7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Gm20521D3Z5F7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Gm20521D3Z5F7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Gm20521D3Z5F7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Gm20521D3Z5F7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Gm20521D3Z5F7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Gm20521D3Z5F7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Gm20521D3Z5F7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gm20521D3Z5F7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gm20521D3Z5F7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gm20521D3Z5F7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gm20521D3Z5F7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Gm20521D3Z5F7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Gm20521D3Z5F7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Gm20521D3Z5F7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Gm20521D3Z5F7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gm20521D3Z5F7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gm20521D3Z5F7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gm20521D3Z5F7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Gm20521D3Z5F7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gm20521D3Z5F7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Gm20521D3Z5F7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gm20521D3Z5F7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gm20521D3Z5F7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gm20521D3Z5F7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Gm20521D3Z5F7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Gm20521D3Z5F7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gm20521D3Z5F7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gm20521D3Z5F7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gm20521D3Z5F7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gm20521D3Z5F7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gm20521D3Z5F7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Gm20521D3Z5F7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gm20521D3Z5F7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gm20521D3Z5F7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gm20521D3Z5F7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gm20521D3Z5F7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gm20521D3Z5F7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gm20521D3Z5F7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gm20521D3Z5F7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Gm20521D3Z5F7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Gm20521D3Z5F7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Gm20521D3Z5F7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Gm20521D3Z5F7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Gm20521D3Z5F7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Gm20521D3Z5F7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.7 ms