Protein–RNA interactions for Protein: D3Z460

Gm1330, Predicted gene 1330, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1330D3Z460 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1330D3Z460 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm1330D3Z460 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm1330D3Z460 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm1330D3Z460 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm1330D3Z460 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm1330D3Z460 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm1330D3Z460 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm1330D3Z460 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm1330D3Z460 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms