Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim12cD3Z3L3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim12cD3Z3L3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim12cD3Z3L3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim12cD3Z3L3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim12cD3Z3L3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim12cD3Z3L3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim12cD3Z3L3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim12cD3Z3L3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim12cD3Z3L3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim12cD3Z3L3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim12cD3Z3L3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms