Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfbr3lD3YZZ2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms