Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc170D3YXL0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc170D3YXL0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms