Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Samd1D3YXK1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samd1D3YXK1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samd1D3YXK1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms