Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
9230113P08RikD3YWX3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9230113P08RikD3YWX3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms