Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim30cD3YVI9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms