Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx8D3YU81 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx8D3YU81 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfx8D3YU81 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms