Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nxpe3B9EKK6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nxpe3B9EKK6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms