Protein–RNA interactions for Protein: B8JK39

Itga9, Integrin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga9B8JK39 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Itga9B8JK39 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itga9B8JK39 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga9B8JK39 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms