Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf11cB4XVP9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Phf11cB4XVP9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf11cB4XVP9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.3 ms