Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rd3lB2RV38 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rd3lB2RV38 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rd3lB2RV38 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms